Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPAT3Q53EU6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPAT3Q53EU6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms