Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPRNQ4KMQ1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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