Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00303Q3SY05 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00303Q3SY05 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms