Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LETM2Q2VYF4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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