Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPROQ16827 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPROQ16827 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTPROQ16827 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPROQ16827 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPROQ16827 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPROQ16827 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPROQ16827 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPROQ16827 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPROQ16827 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPROQ16827 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPROQ16827 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPROQ16827 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPROQ16827 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPROQ16827 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPROQ16827 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPROQ16827 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPROQ16827 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPROQ16827 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPROQ16827 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPROQ16827 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPROQ16827 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPROQ16827 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
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