Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCK2Q16822 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms