Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTF1Q16619 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
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