Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NREPQ16612 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NREPQ16612 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NREPQ16612 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NREPQ16612 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NREPQ16612 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NREPQ16612 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NREPQ16612 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NREPQ16612 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NREPQ16612 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NREPQ16612 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NREPQ16612 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
NREPQ16612 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NREPQ16612 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NREPQ16612 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NREPQ16612 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NREPQ16612 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
NREPQ16612 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NREPQ16612 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NREPQ16612 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NREPQ16612 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NREPQ16612 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NREPQ16612 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NREPQ16612 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NREPQ16612 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NREPQ16612 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NREPQ16612 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NREPQ16612 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NREPQ16612 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NREPQ16612 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NREPQ16612 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NREPQ16612 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NREPQ16612 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NREPQ16612 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NREPQ16612 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NREPQ16612 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NREPQ16612 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NREPQ16612 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NREPQ16612 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NREPQ16612 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NREPQ16612 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NREPQ16612 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NREPQ16612 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NREPQ16612 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NREPQ16612 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NREPQ16612 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NREPQ16612 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NREPQ16612 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NREPQ16612 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NREPQ16612 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NREPQ16612 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NREPQ16612 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms