Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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