Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FXNQ16595 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FXNQ16595 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FXNQ16595 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FXNQ16595 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FXNQ16595 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FXNQ16595 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FXNQ16595 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FXNQ16595 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FXNQ16595 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FXNQ16595 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FXNQ16595 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FXNQ16595 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FXNQ16595 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FXNQ16595 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FXNQ16595 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FXNQ16595 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FXNQ16595 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FXNQ16595 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FXNQ16595 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FXNQ16595 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FXNQ16595 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FXNQ16595 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FXNQ16595 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FXNQ16595 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FXNQ16595 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FXNQ16595 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FXNQ16595 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FXNQ16595 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FXNQ16595 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FXNQ16595 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FXNQ16595 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FXNQ16595 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FXNQ16595 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FXNQ16595 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
FXNQ16595 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FXNQ16595 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FXNQ16595 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FXNQ16595 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FXNQ16595 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FXNQ16595 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FXNQ16595 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FXNQ16595 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FXNQ16595 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FXNQ16595 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FXNQ16595 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FXNQ16595 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FXNQ16595 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FXNQ16595 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FXNQ16595 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FXNQ16595 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FXNQ16595 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FXNQ16595 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FXNQ16595 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FXNQ16595 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FXNQ16595 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FXNQ16595 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FXNQ16595 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FXNQ16595 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FXNQ16595 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FXNQ16595 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FXNQ16595 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FXNQ16595 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FXNQ16595 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FXNQ16595 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FXNQ16595 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FXNQ16595 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FXNQ16595 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FXNQ16595 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FXNQ16595 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FXNQ16595 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FXNQ16595 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FXNQ16595 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FXNQ16595 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FXNQ16595 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FXNQ16595 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FXNQ16595 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FXNQ16595 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FXNQ16595 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
FXNQ16595 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FXNQ16595 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FXNQ16595 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FXNQ16595 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FXNQ16595 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FXNQ16595 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FXNQ16595 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
FXNQ16595 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FXNQ16595 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FXNQ16595 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FXNQ16595 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FXNQ16595 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FXNQ16595 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FXNQ16595 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FXNQ16595 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FXNQ16595 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FXNQ16595 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FXNQ16595 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FXNQ16595 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FXNQ16595 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FXNQ16595 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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