Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGN3Q15651 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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