Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIP10Q15642 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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