Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCEA2Q15560 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCEA2Q15560 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms