Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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PTPRRQ15256 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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PTPRRQ15256 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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PTPRRQ15256 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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PTPRRQ15256 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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PTPRRQ15256 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRRQ15256 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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