Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PDGFRLQ15198 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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