Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCOLCEQ15113 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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