Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHPRHQ149N8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SHPRHQ149N8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
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