Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
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