Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE1CQ14123 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms