Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNTB1Q13884 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms