Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDX39BQ13838 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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