Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP1A4Q13733 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP1A4Q13733 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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