Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSTA3Q13630 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms