Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CUL4BQ13620 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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