Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TOP3AQ13472 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOP3AQ13472 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms