Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPA4Q13156 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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