Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms