Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NFIAQ12857 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
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