Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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