Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NCBP1Q09161 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NCBP1Q09161 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms