Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms