Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms