Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP7AQ04656 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP7AQ04656 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms