Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARID5AQ03989 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms