Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CAV1Q03135 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms