Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2BQ00403 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms