Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATP2C1P98194 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP2C1P98194 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms