Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
FAM3AP98173 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM3AP98173 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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