Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCNA1P78396 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCNA1P78396 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCNA1P78396 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCNA1P78396 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCNA1P78396 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCNA1P78396 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNA1P78396 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms