Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PIP4K2BP78356 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PIP4K2BP78356 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PIP4K2BP78356 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PIP4K2BP78356 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PIP4K2BP78356 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PIP4K2BP78356 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIP4K2BP78356 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIP4K2BP78356 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIP4K2BP78356 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIP4K2BP78356 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIP4K2BP78356 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIP4K2BP78356 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms