Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNAP25P60880 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP25P60880 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms