Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFC1P60507 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms