Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIPPLY3P57055 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIPPLY3P57055 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms