Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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PGGT1BP53609 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PGGT1BP53609 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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PGGT1BP53609 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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PGGT1BP53609 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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PGGT1BP53609 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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PGGT1BP53609 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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PGGT1BP53609 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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PGGT1BP53609 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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PGGT1BP53609 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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PGGT1BP53609 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP53609 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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