Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RORCP51449 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORCP51449 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORCP51449 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORCP51449 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORCP51449 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORCP51449 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORCP51449 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORCP51449 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORCP51449 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORCP51449 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORCP51449 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORCP51449 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORCP51449 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RORCP51449 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RORCP51449 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORCP51449 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORCP51449 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORCP51449 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORCP51449 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RORCP51449 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORCP51449 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORCP51449 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORCP51449 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORCP51449 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORCP51449 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORCP51449 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RORCP51449 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORCP51449 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORCP51449 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORCP51449 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORCP51449 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORCP51449 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORCP51449 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORCP51449 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORCP51449 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORCP51449 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORCP51449 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORCP51449 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORCP51449 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORCP51449 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORCP51449 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORCP51449 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORCP51449 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORCP51449 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORCP51449 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORCP51449 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORCP51449 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORCP51449 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORCP51449 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORCP51449 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORCP51449 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORCP51449 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORCP51449 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORCP51449 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORCP51449 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RORCP51449 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RORCP51449 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RORCP51449 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RORCP51449 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RORCP51449 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RORCP51449 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RORCP51449 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RORCP51449 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RORCP51449 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RORCP51449 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RORCP51449 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RORCP51449 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RORCP51449 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RORCP51449 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RORCP51449 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RORCP51449 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RORCP51449 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RORCP51449 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RORCP51449 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RORCP51449 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RORCP51449 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RORCP51449 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RORCP51449 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RORCP51449 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RORCP51449 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RORCP51449 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RORCP51449 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RORCP51449 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RORCP51449 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RORCP51449 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RORCP51449 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RORCP51449 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RORCP51449 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RORCP51449 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RORCP51449 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RORCP51449 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RORCP51449 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RORCP51449 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RORCP51449 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RORCP51449 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RORCP51449 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RORCP51449 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RORCP51449 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RORCP51449 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms