Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCAMP50895 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCAMP50895 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCAMP50895 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCAMP50895 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCAMP50895 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCAMP50895 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAMP50895 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAMP50895 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAMP50895 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAMP50895 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAMP50895 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAMP50895 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAMP50895 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAMP50895 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAMP50895 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAMP50895 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAMP50895 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAMP50895 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAMP50895 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAMP50895 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAMP50895 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAMP50895 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAMP50895 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAMP50895 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAMP50895 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAMP50895 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAMP50895 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAMP50895 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCAMP50895 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BCAMP50895 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BCAMP50895 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BCAMP50895 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BCAMP50895 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BCAMP50895 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
BCAMP50895 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BCAMP50895 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BCAMP50895 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAMP50895 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAMP50895 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAMP50895 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAMP50895 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAMP50895 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAMP50895 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAMP50895 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAMP50895 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAMP50895 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAMP50895 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAMP50895 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAMP50895 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAMP50895 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAMP50895 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAMP50895 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAMP50895 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAMP50895 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAMP50895 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAMP50895 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAMP50895 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAMP50895 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAMP50895 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAMP50895 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAMP50895 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAMP50895 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCAMP50895 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCAMP50895 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCAMP50895 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCAMP50895 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCAMP50895 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCAMP50895 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCAMP50895 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCAMP50895 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCAMP50895 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCAMP50895 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCAMP50895 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BCAMP50895 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCAMP50895 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCAMP50895 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCAMP50895 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BCAMP50895 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCAMP50895 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCAMP50895 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCAMP50895 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCAMP50895 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCAMP50895 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCAMP50895 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCAMP50895 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCAMP50895 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCAMP50895 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCAMP50895 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCAMP50895 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCAMP50895 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCAMP50895 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCAMP50895 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCAMP50895 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCAMP50895 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BCAMP50895 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCAMP50895 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCAMP50895 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BCAMP50895 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCAMP50895 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms