Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK8P49336 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK8P49336 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK8P49336 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK8P49336 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK8P49336 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK8P49336 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK8P49336 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK8P49336 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK8P49336 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK8P49336 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK8P49336 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK8P49336 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK8P49336 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK8P49336 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK8P49336 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK8P49336 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK8P49336 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK8P49336 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK8P49336 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK8P49336 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK8P49336 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK8P49336 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK8P49336 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK8P49336 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK8P49336 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK8P49336 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK8P49336 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK8P49336 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK8P49336 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK8P49336 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK8P49336 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK8P49336 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK8P49336 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK8P49336 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK8P49336 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK8P49336 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK8P49336 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK8P49336 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK8P49336 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK8P49336 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK8P49336 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK8P49336 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK8P49336 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK8P49336 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK8P49336 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK8P49336 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK8P49336 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK8P49336 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK8P49336 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK8P49336 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK8P49336 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK8P49336 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK8P49336 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK8P49336 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK8P49336 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK8P49336 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK8P49336 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK8P49336 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK8P49336 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK8P49336 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK8P49336 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK8P49336 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK8P49336 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK8P49336 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK8P49336 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK8P49336 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK8P49336 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK8P49336 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK8P49336 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK8P49336 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK8P49336 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK8P49336 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK8P49336 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK8P49336 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK8P49336 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK8P49336 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK8P49336 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK8P49336 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK8P49336 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK8P49336 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK8P49336 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK8P49336 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK8P49336 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK8P49336 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK8P49336 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK8P49336 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK8P49336 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK8P49336 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK8P49336 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK8P49336 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK8P49336 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK8P49336 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK8P49336 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK8P49336 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK8P49336 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK8P49336 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK8P49336 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK8P49336 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK8P49336 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms