Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A9P48067 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms