Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDKN1BP46527 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms