Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RECQLP46063 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RECQLP46063 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RECQLP46063 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RECQLP46063 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RECQLP46063 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RECQLP46063 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RECQLP46063 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RECQLP46063 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RECQLP46063 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RECQLP46063 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RECQLP46063 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RECQLP46063 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RECQLP46063 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RECQLP46063 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RECQLP46063 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RECQLP46063 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RECQLP46063 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RECQLP46063 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RECQLP46063 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RECQLP46063 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RECQLP46063 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RECQLP46063 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RECQLP46063 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RECQLP46063 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RECQLP46063 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RECQLP46063 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RECQLP46063 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RECQLP46063 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RECQLP46063 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RECQLP46063 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RECQLP46063 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RECQLP46063 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RECQLP46063 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RECQLP46063 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RECQLP46063 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RECQLP46063 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RECQLP46063 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RECQLP46063 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RECQLP46063 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RECQLP46063 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RECQLP46063 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RECQLP46063 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RECQLP46063 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RECQLP46063 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RECQLP46063 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RECQLP46063 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RECQLP46063 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RECQLP46063 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RECQLP46063 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RECQLP46063 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RECQLP46063 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RECQLP46063 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RECQLP46063 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RECQLP46063 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RECQLP46063 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RECQLP46063 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RECQLP46063 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RECQLP46063 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RECQLP46063 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RECQLP46063 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RECQLP46063 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RECQLP46063 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RECQLP46063 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RECQLP46063 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms